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Murió en 1540. No se sabe cuándo llegó a México ni si acompañó a Hernán Cortés en su primera expedición a California. Las opiniones de las personas más autorizadas están divididas acerca de estos interrogantes. Diaz del Castillo cuenta que durante la ausencia de Cortés, su esposa, Doña Juana de Zuñiga (Juñeja), le envió cartas a través de Ulloa, rogándole que retornara. Ulloa, encargado de dos naves cargadas con provisiones, alcanzó a Cortés cuando éste estaba gravemente falto de éstas, y retornó a México en 1537. Al poco tiempo Ulloa lo siguió. Ávido de nuevos descubrimientos, Cortés emprendió una expedición costeada por él mismo en 1538, despachó una flota de tres embarcaciones bajo el mando de Francisco de Ulloa. Según Clavigero, Ulloa navegó a lo largo de las costas de la península de California hasta que fue obligado a retornar a Nueva España a causa de la falta de provisiones, en 1540, donde, según Díaz del Castillo, fue apuñalado por un soldado y murió. Otros historiadores relatan, sin embargo, que de las tres embarcaciones con las que navegó desde el puerto de Acapulco, el "Santo Tomás" fue abandonado pronto; el "Santa Águeda" fue obligado a buscar un puerto en Manzanillo para reparar daños, y al poco tiempo fue conducido por una tempestad a las playas de Culiacán, donde se unió la "Trinidad", retornando al poco tiempo causando el descontento de los miembros de la expedición, y la nave "Trinidad", bajo el mando de Ulloa, fue abandonada, sin haberse encontrado rastros de ésta.

CAMILLUS CRIVELLI 
Transcrito por Carol Kerstner
Traducido por Ricardo Pablo Salvador